甲醛穿孔萃取儀在萃取期間保持每分鐘 30mL 恒定回流速度，這樣，一可以防止液封三角燒瓶中的水，虹吸回到萃取管中，二可以使穿孔器中的甲苯液柱保持一定的高度，使冷凝下來的帶有甲醇的甲苯從孔器的底部穿孔而出并溶于水中。甲苯因比重小于 1 ，浮到水面之上，并通過萃取管的小虹吸管，而返回到燒瓶中繼續其液固萃取到2為止。在整個加熱萃取過程中，均須有專人看管以免以生意外事故。甲醛穿孔萃取儀在萃取結束時，移開加熱器，讓儀器迅速冷卻，此時三角燒瓶中的液封水會通過冷凝管回到萃取管中，起到了洗滌儀器上半部的作用。

　　甲醛穿孔萃取儀的萃取管的水面不能超過標準所示的zui高水位線，以免甲醇吸收水溶液通過小虹吸管進入燒瓶。為了防止上述現象，可將萃取管中吸收液轉移一部分入 2000mL 容量瓶，再向錐形瓶加入 200mL 蒸餾水，直到此系統中壓力達到平衡。開啟萃取管部的活塞，將甲醇吸收液全部轉到2000mL 容量瓶中，再加兩份 200mL 蒸餾水到三角燒瓶中，并讓它虹吸回流到萃取管中，合并轉移到 2000mL 容量瓶中。將容量瓶用蒸餾水稀釋到刻度，若有少量甲苯混入，可用漏管吸除后再定容、搖勻、待定量。在萃取過程中若有漏氣或停電間斷，此項試驗須重新進行。試驗用過的甲苯屬易燃品應妥善處理，有條件的話亦可重蒸脫水而使用。